Het is opvallend dat, hoewel hij een grote invloed heeft uitgeoefend op de scholastieke theologie van het Latijnse Westen, Averroës niet veel achting kon opbrengen voor de Islamitische theologen die zich bezighielden met de zogenaamde kalaam. Hij vond ze niet rationalistische genoeg; hun dialectische methoden konden zijn goedkeuring niet wegdragen. De rationele filosofen konden wel op zijn steun rekenen, in tegenstelling tot mystici, die naar zijn mening de debatten vertroebelen door het gebruik van metaforen en analogen, die door oningewijden voor letterlijke waarheid worden aangezien.
Het gedachtengoed van Averroës is vooral tot uiting gekomen in zijn talrijke commentaren op de werken van Aristoteles. Hij schreef drie soorten commentaren: kort, middellang en lang. Voor sommige werken van Aristoteles zijn alle drie de soorten commentaar geschreven en behouden (zie de bibliografie onder deze inleiding). De verschillende soorten commentaren verschillen niet alleen qua lengte, ook inhoudelijk zijn er verschillen aan te wijzen. De korte commentaren bestaan vooral uit een samenvatting of parafrase van het besproken werk. De middellange commentaren volgen de oorspronkelijke tekst en wijden slechts hier en daar uit met de persoonlijke mening van Averroës. De lange commentaren bevatten meestal naast de mening van Averroës ook nog samenvattingen van commentaren van Griekse en Arabische filosofen.Logica
Kort commentaar op de Organon van Aristoteles
Commentaar op de Isagoge van Porphyrius
Commentaar op de Categoriën van Aristoteles
Commentaar op Over de interpretatie van Aristoteles
Commentaar op de Analytica priora van Aristoteles
Commentaar op de Analytica posteriora van Aristoteles
Commentaar op de Topica van Aristoteles
Commentaar op de Sofistische weerleggingen van Aristoteles
Commentaar op de Retorica van Aristoteles
Commentaar op de Poetica van Aristoteles
Lang commentaar op de Analytica priora van Aristoteles
Lang commentaar op de Analytica posteriora van Aristoteles
Vragen over de logica
Over al-Farabi over de Isagoge over genus en differentia
Over substantiële en bijkomstige universalia
Over de copula en de afgeleide zelfstandige naamwoorden
Over samengestelde en enkelvoudige predicaten
Vragen over de Analytica priora van Aristoteles [verscheidene werken]
Vragen over de Analytica posteriora van Aristoteles [verscheidene werken]
Natuurfilosofie
Kort commentaar op de Fysica van Aristoteles
Commentaar op de Fysica van Aristoteles
Lang commentaar op de Fysica van Aristoteles
Kort commentaar op Over de hemelen van Aristoteles
Commentaar op Over de hemelen van Aristoteles
Lang commentaar op Over de hemelen van Aristoteles
Kort commentaar op Over het ontstaan en het vergaan van Aristoteles
Commentaar op Over het ontstaan en het vergaan van Aristoteles
Kort commentaar op de Meteorologica van Aristoteles
Commentaar op de Meteorologica van Aristoteles
Commentaar op Over de dieren van al-Jahith
Hoofdstuk over dieren
Kort commentaar op Over planten van Nicolaas van Damascus
Vragen over de natuurfilosofie
Psychologie
Het boek van de ziel [een kort commentaar op Over de ziel van Aristoteles]
Commentaar op Over de ziel van Aristoteles
Lang commentaar op Over de ziel van Aristoteles
Commentaar op de Korte traktaten over de natuur van Aristoteles
Brief over de mogelijkheid van verbinding
Hoofdstuk over de verbinding van het abstracte intellect en de mens
Hoofdstuk over de verbinding van intellect en mens
Hoofdstuk over het intellect
Commentaar op het traktaat over het intellect van Alexander
Commentaar op het epistel over de verbinding van het intellect en de mens door Avempace
Diverse onderwerpen
Kort commentaar op de Metafysica van Aristoteles
Commentaar op de Metafysica van Aristoteles
Lang commentaar op de Metafysica van Aristoteles
Commentaar op de Ethica Nicomachea
Samenvatting van de Staat van Plato
Samenvatting van de Almagest van Ptolemeus